硒蛋白基因家族及相关基因的表达数据和生物学功能
基因功能: 磷脂过氧化物酶,防止铁死亡的主要抗氧化酶
器官表达: 肝脏(12.45 TPM), 肾脏(9.32 TPM), 大脑(8.17 TPM)
癌症表达: 乳腺癌(-0.32), 肺癌(-0.51), 肝癌(-0.72)
硒处理效应: 硒处理后上调1.32 log2FC
| 器官 | TPM值 | HPA IHC强度 | RNA-protein一致性 |
|---|---|---|---|
| 肝脏 | 12.45 TPM | 高强度 | r=0.85 |
| 肾脏 | 9.32 TPM | 高强度 | r=0.82 |
| 大脑 | 8.17 TPM | 中等强度 | r=0.78 |
| 甲状腺 | 5.89 TPM | 中等强度 | r=0.71 |
抗氧化功能: 清除脂质过氧化物,保护细胞膜完整性
铁死亡调节: GPX4是铁死亡的关键调节因子
癌症相关: GPX4下调增加癌细胞铁死亡敏感性
基因功能: 硒转运蛋白,负责硒的系统分配
器官表达: 肝脏(15.32 TPM), 肾脏(8.94 TPM), 大脑(7.21 TPM)
癌症表达: 乳腺癌(-0.67), 肺癌(-0.89), 肝癌(-1.23)
硒处理效应: 硒处理后上调2.15 log2FC
| 器官 | TPM值 | HPA IHC强度 | RNA-protein一致性 |
|---|---|---|---|
| 肝脏 | 15.32 TPM | 高强度 | r=0.91 |
| 肾脏 | 8.94 TPM | 中等强度 | r=0.88 |
| 大脑 | 7.21 TPM | 中等强度 | r=0.85 |
| 心脏 | 5.43 TPM | 低强度 | r=0.72 |
硒转运: SELENOP是主要的硒转运蛋白,负责硒的系统分配
硒状态指示: SELENOP表达水平反映机体硒水平
癌症相关: SELENOP下调可能导致硒供应不足
基因功能: 硫氧还蛋白系统关键酶,抗氧化功能
器官表达: 甲状腺(9.42 TPM), 肝脏(10.18 TPM), 肾脏(8.76 TPM)
癌症表达: 乳腺癌(0.45), 肺癌(0.38), 肝癌(0.21)
硒处理效应: 硒处理后上调0.89 log2FC
| 器官 | TPM值 | HPA IHC强度 | RNA-protein一致性 |
|---|---|---|---|
| 甲状腺 | 9.42 TPM | 高强度 | r=0.78 |
| 肝脏 | 10.18 TPM | 高强度 | r=0.76 |
| 肾脏 | 8.76 TPM | 高强度 | r=0.74 |
| 大脑0td> | 6.34 TPM | 中等强度 | r=0.68 |
抗氧化功能: TXNRD1是硫氧还蛋白系统关键酶
甲状腺激素合成: TXNRD1在甲状腺激素合成中起关键作用
癌症相关: TXNRD1上调可能增加癌细胞抗氧化能力
基因功能: 血浆抗氧化酶,主要存在于血浆中
器官表达: 肾脏(11.23 TPM), 肝脏(7.45 TPM), 大脑(3.21 TPM)
癌症表达: 乳腺癌(-0.21), 肺癌(-0.25), 肝癌(-0.34)
硒处理效应: 硒处理后上调0.76 log2FC
| 器官 | TPM值 | HPA IHC强度 | RNA-protein一致性 |
|---|---|---|---|
| 肾脏 | 11.23 TPM | 高强度 | r=0.76 |
| 肝脏 | 7.45 TPM | 中等强度 | r=0.73 |
| 大脑 | 3.21 TPM | 低强度 | r=0.62 |
| 甲状腺 | 1.32 TPM | 未检测到 | r=0.45 |
血浆抗氧化: GPX3是血浆主要抗氧化酶
肾脏特异性: GPX3在肾脏表达最高
心血管保护: GPX3对心血管系统有保护作用
TPM标准化原理:TPM (Transcripts Per Million) = (reads/基因长度) × 10⁶ / Σ(reads/所有基因长度)。TPM考虑了基因长度和测序深度,使不同样本间的比较更加准确。
差异表达原理:log2FoldChange = log₂(癌症表达均值/正常表达均值)。正值>1表示上调,负值<-1表示下调。